]> git.notmuchmail.org Git - notmuch/blobdiff - lib/database.cc
Switch from random to sequential thread identifiers.
[notmuch] / lib / database.cc
index b6c4d07b794eb37ccdb73b68a31c993fc2326be8..8641321511bd12c85eac6e1c91fe9c486d92e4c5 100644 (file)
@@ -22,6 +22,8 @@
 
 #include <iostream>
 
+#include <sys/time.h>
+#include <signal.h>
 #include <xapian.h>
 
 #include <glib.h> /* g_free, GPtrArray, GHashTable */
@@ -35,9 +37,14 @@ typedef struct {
     const char *prefix;
 } prefix_t;
 
-/* Here's the current schema for our database:
+#define NOTMUCH_DATABASE_VERSION 1
+
+#define STRINGIFY(s) _SUB_STRINGIFY(s)
+#define _SUB_STRINGIFY(s) #s
+
+/* Here's the current schema for our database (for NOTMUCH_DATABASE_VERSION):
  *
- * We currently have two different types of documents: mail and timestamps.
+ * We currently have two different types of documents: mail and directory.
  *
  * Mail document
  * -------------
@@ -63,6 +70,12 @@ typedef struct {
  *
  *     tag:       Any tags associated with this message by the user.
  *
+ *     file-direntry:  A colon-separated pair of values
+ *                     (INTEGER:STRING), where INTEGER is the
+ *                     document ID of a directory document, and
+ *                     STRING is the name of a file within that
+ *                     directory for this mail message.
+ *
  *    A mail document also has two values:
  *
  *     TIMESTAMP:      The time_t value corresponding to the message's
@@ -75,21 +88,36 @@ typedef struct {
  * user in searching. But the database doesn't really care itself
  * about any of these.
  *
- * Timestamp document
+ * The data portion of a mail document is empty.
+ *
+ * Directory document
  * ------------------
- * A timestamp document is used by a client of the notmuch library to
+ * A directory document is used by a client of the notmuch library to
  * maintain data necessary to allow for efficient polling of mail
- * directories. The notmuch library does no interpretation of
- * timestamps, but merely allows the user to store and retrieve
- * timestamps as name/value pairs.
+ * directories.
+ *
+ * All directory documents contain one term:
  *
- * The timestamp document is indexed with a single prefixed term:
+ *     directory:      The directory path (relative to the database path)
+ *                     Or the SHA1 sum of the directory path (if the
+ *                     path itself is too long to fit in a Xapian
+ *                     term).
  *
- *     timestamp:      The user's key value (likely a directory name)
+ * And all directory documents for directories other than top-level
+ * directories also contain the following term:
  *
- * and has a single value:
+ *     directory-direntry: A colon-separated pair of values
+ *                         (INTEGER:STRING), where INTEGER is the
+ *                         document ID of the parent directory
+ *                         document, and STRING is the name of this
+ *                         directory within that parent.
  *
- *     TIMESTAMP:      The time_t value from the user.
+ * All directory documents have a single value:
+ *
+ *     TIMESTAMP:      The mtime of the directory (at last scan)
+ *
+ * The data portion of a directory document contains the path of the
+ * directory (relative to the database path).
  */
 
 /* With these prefix values we follow the conventions published here:
@@ -108,23 +136,25 @@ typedef struct {
  */
 
 prefix_t BOOLEAN_PREFIX_INTERNAL[] = {
-    { "type", "T" },
-    { "reference", "XREFERENCE" },
-    { "replyto", "XREPLYTO" },
-    { "timestamp", "XTIMESTAMP" },
+    { "type",                  "T" },
+    { "reference",             "XREFERENCE" },
+    { "replyto",               "XREPLYTO" },
+    { "directory",             "XDIRECTORY" },
+    { "file-direntry",         "XFDIRENTRY" },
+    { "directory-direntry",    "XDDIRENTRY" },
 };
 
 prefix_t BOOLEAN_PREFIX_EXTERNAL[] = {
-    { "thread", "G" },
-    { "tag", "K" },
-    { "id", "Q" }
+    { "thread",                        "G" },
+    { "tag",                   "K" },
+    { "id",                    "Q" }
 };
 
 prefix_t PROBABILISTIC_PREFIX[]= {
-    { "from", "XFROM" },
-    { "to", "XTO" },
-    { "attachment", "XATTACHMENT" },
-    { "subject", "XSUBJECT"}
+    { "from",                  "XFROM" },
+    { "to",                    "XTO" },
+    { "attachment",            "XATTACHMENT" },
+    { "subject",               "XSUBJECT"}
 };
 
 int
@@ -175,8 +205,8 @@ notmuch_status_to_string (notmuch_status_t status)
        return "No error occurred";
     case NOTMUCH_STATUS_OUT_OF_MEMORY:
        return "Out of memory";
-    case NOTMUCH_STATUS_READONLY_DATABASE:
-       return "The database is read-only";
+    case NOTMUCH_STATUS_READ_ONLY_DATABASE:
+       return "Attempt to write to a read-only database";
     case NOTMUCH_STATUS_XAPIAN_EXCEPTION:
        return "A Xapian exception occurred";
     case NOTMUCH_STATUS_FILE_ERROR:
@@ -197,6 +227,17 @@ notmuch_status_to_string (notmuch_status_t status)
     }
 }
 
+static void
+find_doc_ids_for_term (notmuch_database_t *notmuch,
+                      const char *term,
+                      Xapian::PostingIterator *begin,
+                      Xapian::PostingIterator *end)
+{
+    *begin = notmuch->xapian_db->postlist_begin (term);
+
+    *end = notmuch->xapian_db->postlist_end (term);
+}
+
 static void
 find_doc_ids (notmuch_database_t *notmuch,
              const char *prefix_name,
@@ -204,24 +245,21 @@ find_doc_ids (notmuch_database_t *notmuch,
              Xapian::PostingIterator *begin,
              Xapian::PostingIterator *end)
 {
-    Xapian::PostingIterator i;
     char *term;
 
     term = talloc_asprintf (notmuch, "%s%s",
                            _find_prefix (prefix_name), value);
 
-    *begin = notmuch->xapian_db->postlist_begin (term);
-
-    *end = notmuch->xapian_db->postlist_end (term);
+    find_doc_ids_for_term (notmuch, term, begin, end);
 
     talloc_free (term);
 }
 
-static notmuch_private_status_t
-find_unique_doc_id (notmuch_database_t *notmuch,
-                   const char *prefix_name,
-                   const char *value,
-                   unsigned int *doc_id)
+notmuch_private_status_t
+_notmuch_database_find_unique_doc_id (notmuch_database_t *notmuch,
+                                     const char *prefix_name,
+                                     const char *value,
+                                     unsigned int *doc_id)
 {
     Xapian::PostingIterator i, end;
 
@@ -230,10 +268,19 @@ find_unique_doc_id (notmuch_database_t *notmuch,
     if (i == end) {
        *doc_id = 0;
        return NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_NO_DOCUMENT_FOUND;
-    } else {
-       *doc_id = *i;
-       return NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_SUCCESS;
     }
+
+    *doc_id = *i;
+
+#if DEBUG_DATABASE_SANITY
+    i++;
+
+    if (i != end)
+       INTERNAL_ERROR ("Term %s:%s is not unique as expected.\n",
+                       prefix_name, value);
+#endif
+
+    return NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_SUCCESS;
 }
 
 static Xapian::Document
@@ -242,26 +289,6 @@ find_document_for_doc_id (notmuch_database_t *notmuch, unsigned doc_id)
     return notmuch->xapian_db->get_document (doc_id);
 }
 
-static notmuch_private_status_t
-find_unique_document (notmuch_database_t *notmuch,
-                     const char *prefix_name,
-                     const char *value,
-                     Xapian::Document *document,
-                     unsigned int *doc_id)
-{
-    notmuch_private_status_t status;
-
-    status = find_unique_doc_id (notmuch, prefix_name, value, doc_id);
-
-    if (status) {
-       *document = Xapian::Document ();
-       return status;
-    }
-
-    *document = find_document_for_doc_id (notmuch, *doc_id);
-    return NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_SUCCESS;
-}
-
 notmuch_message_t *
 notmuch_database_find_message (notmuch_database_t *notmuch,
                               const char *message_id)
@@ -269,7 +296,8 @@ notmuch_database_find_message (notmuch_database_t *notmuch,
     notmuch_private_status_t status;
     unsigned int doc_id;
 
-    status = find_unique_doc_id (notmuch, "id", message_id, &doc_id);
+    status = _notmuch_database_find_unique_doc_id (notmuch, "id",
+                                                  message_id, &doc_id);
 
     if (status == NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_NO_DOCUMENT_FOUND)
        return NULL;
@@ -446,6 +474,7 @@ notmuch_database_create (const char *path)
 
     notmuch = notmuch_database_open (path,
                                     NOTMUCH_DATABASE_MODE_READ_WRITE);
+    notmuch_database_upgrade (notmuch, NULL, NULL);
 
   DONE:
     if (notmuch_path)
@@ -454,6 +483,17 @@ notmuch_database_create (const char *path)
     return notmuch;
 }
 
+notmuch_status_t
+_notmuch_database_ensure_writable (notmuch_database_t *notmuch)
+{
+    if (notmuch->mode == NOTMUCH_DATABASE_MODE_READ_ONLY) {
+       fprintf (stderr, "Cannot write to a read-only database.\n");
+       return NOTMUCH_STATUS_READ_ONLY_DATABASE;
+    }
+
+    return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+}
+
 notmuch_database_t *
 notmuch_database_open (const char *path,
                       notmuch_database_mode_t mode)
@@ -462,7 +502,7 @@ notmuch_database_open (const char *path,
     char *notmuch_path = NULL, *xapian_path = NULL;
     struct stat st;
     int err;
-    unsigned int i;
+    unsigned int i, version;
 
     if (asprintf (&notmuch_path, "%s/%s", path, ".notmuch") == -1) {
        notmuch_path = NULL;
@@ -490,14 +530,59 @@ notmuch_database_open (const char *path,
     if (notmuch->path[strlen (notmuch->path) - 1] == '/')
        notmuch->path[strlen (notmuch->path) - 1] = '\0';
 
+    notmuch->needs_upgrade = FALSE;
     notmuch->mode = mode;
     try {
+       string last_thread_id;
+
        if (mode == NOTMUCH_DATABASE_MODE_READ_WRITE) {
            notmuch->xapian_db = new Xapian::WritableDatabase (xapian_path,
                                                               Xapian::DB_CREATE_OR_OPEN);
+           version = notmuch_database_get_version (notmuch);
+
+           if (version > NOTMUCH_DATABASE_VERSION) {
+               fprintf (stderr,
+                        "Error: Notmuch database at %s\n"
+                        "       has a newer database format version (%u) than supported by this\n"
+                        "       version of notmuch (%u). Refusing to open this database in\n"
+                        "       read-write mode.\n",
+                        notmuch_path, version, NOTMUCH_DATABASE_VERSION);
+               notmuch->mode = NOTMUCH_DATABASE_MODE_READ_ONLY;
+               notmuch_database_close (notmuch);
+               notmuch = NULL;
+               goto DONE;
+           }
+
+           if (version < NOTMUCH_DATABASE_VERSION)
+               notmuch->needs_upgrade = TRUE;
        } else {
            notmuch->xapian_db = new Xapian::Database (xapian_path);
+           version = notmuch_database_get_version (notmuch);
+           if (version > NOTMUCH_DATABASE_VERSION)
+           {
+               fprintf (stderr,
+                        "Warning: Notmuch database at %s\n"
+                        "         has a newer database format version (%u) than supported by this\n"
+                        "         version of notmuch (%u). Some operations may behave incorrectly,\n"
+                        "         (but the database will not be harmed since it is being opened\n"
+                        "         in read-only mode).\n",
+                        notmuch_path, version, NOTMUCH_DATABASE_VERSION);
+           }
+       }
+
+       last_thread_id = notmuch->xapian_db->get_metadata ("last_thread_id");
+       if (last_thread_id.empty ()) {
+           notmuch->last_thread_id = 0;
+       } else {
+           const char *str;
+           char *end;
+
+           str = last_thread_id.c_str ();
+           notmuch->last_thread_id = strtoull (str, &end, 16);
+           if (*end != '\0')
+               INTERNAL_ERROR ("Malformed database last_thread_id: %s", str);
        }
+
        notmuch->query_parser = new Xapian::QueryParser;
        notmuch->term_gen = new Xapian::TermGenerator;
        notmuch->term_gen->set_stemmer (Xapian::Stem ("english"));
@@ -560,110 +645,469 @@ notmuch_database_get_path (notmuch_database_t *notmuch)
     return notmuch->path;
 }
 
-static notmuch_private_status_t
-find_timestamp_document (notmuch_database_t *notmuch, const char *db_key,
-                        Xapian::Document *doc, unsigned int *doc_id)
+unsigned int
+notmuch_database_get_version (notmuch_database_t *notmuch)
+{
+    unsigned int version;
+    string version_string;
+    const char *str;
+    char *end;
+
+    version_string = notmuch->xapian_db->get_metadata ("version");
+    if (version_string.empty ())
+       return 0;
+
+    str = version_string.c_str ();
+    if (str == NULL || *str == '\0')
+       return 0;
+
+    version = strtoul (str, &end, 10);
+    if (*end != '\0')
+       INTERNAL_ERROR ("Malformed database version: %s", str);
+
+    return version;
+}
+
+notmuch_bool_t
+notmuch_database_needs_upgrade (notmuch_database_t *notmuch)
 {
-    return find_unique_document (notmuch, "timestamp", db_key, doc, doc_id);
+    return notmuch->needs_upgrade;
 }
 
-/* We allow the user to use arbitrarily long keys for timestamps,
- * (they're for filesystem paths after all, which have no limit we
- * know about). But we have a term-length limit. So if we exceed that,
- * we'll use the SHA-1 of the user's key as the actual key for
- * constructing a database term.
+static volatile sig_atomic_t do_progress_notify = 0;
+
+static void
+handle_sigalrm (unused (int signal))
+{
+    do_progress_notify = 1;
+}
+
+/* Upgrade the current database.
+ *
+ * After opening a database in read-write mode, the client should
+ * check if an upgrade is needed (notmuch_database_needs_upgrade) and
+ * if so, upgrade with this function before making any modifications.
  *
- * Caution: This function returns a newly allocated string which the
- * caller should free() when finished.
+ * The optional progress_notify callback can be used by the caller to
+ * provide progress indication to the user. If non-NULL it will be
+ * called periodically with 'count' as the number of messages upgraded
+ * so far and 'total' the overall number of messages that will be
+ * converted.
  */
-static char *
-timestamp_db_key (const char *key)
+notmuch_status_t
+notmuch_database_upgrade (notmuch_database_t *notmuch,
+                         void (*progress_notify) (void *closure,
+                                                  double progress),
+                         void *closure)
 {
-    int term_len = strlen (_find_prefix ("timestamp")) + strlen (key);
+    Xapian::WritableDatabase *db;
+    struct sigaction action;
+    struct itimerval timerval;
+    notmuch_bool_t timer_is_active = FALSE;
+    unsigned int version;
+    notmuch_status_t status;
+    unsigned int count = 0, total = 0;
+
+    status = _notmuch_database_ensure_writable (notmuch);
+    if (status)
+       return status;
+
+    db = static_cast <Xapian::WritableDatabase *> (notmuch->xapian_db);
+
+    version = notmuch_database_get_version (notmuch);
+
+    if (version >= NOTMUCH_DATABASE_VERSION)
+       return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+
+    if (progress_notify) {
+       /* Setup our handler for SIGALRM */
+       memset (&action, 0, sizeof (struct sigaction));
+       action.sa_handler = handle_sigalrm;
+       sigemptyset (&action.sa_mask);
+       action.sa_flags = SA_RESTART;
+       sigaction (SIGALRM, &action, NULL);
+
+       /* Then start a timer to send SIGALRM once per second. */
+       timerval.it_interval.tv_sec = 1;
+       timerval.it_interval.tv_usec = 0;
+       timerval.it_value.tv_sec = 1;
+       timerval.it_value.tv_usec = 0;
+       setitimer (ITIMER_REAL, &timerval, NULL);
+
+       timer_is_active = TRUE;
+    }
+
+    /* Before version 1, each message document had its filename in the
+     * data field. Copy that into the new format by calling
+     * notmuch_message_add_filename.
+     */
+    if (version < 1) {
+       notmuch_query_t *query = notmuch_query_create (notmuch, "");
+       notmuch_messages_t *messages;
+       notmuch_message_t *message;
+       char *filename;
+       Xapian::TermIterator t, t_end;
+
+       total = notmuch_query_count_messages (query);
+
+       for (messages = notmuch_query_search_messages (query);
+            notmuch_messages_has_more (messages);
+            notmuch_messages_advance (messages))
+       {
+           if (do_progress_notify) {
+               progress_notify (closure, (double) count / total);
+               do_progress_notify = 0;
+           }
+
+           message = notmuch_messages_get (messages);
+
+           filename = _notmuch_message_talloc_copy_data (message);
+           if (filename && *filename != '\0') {
+               _notmuch_message_add_filename (message, filename);
+               _notmuch_message_sync (message);
+           }
+           talloc_free (filename);
+
+           notmuch_message_destroy (message);
+
+           count++;
+       }
+
+       notmuch_query_destroy (query);
+
+       /* Also, before version 1 we stored directory timestamps in
+        * XTIMESTAMP documents instead of the current XDIRECTORY
+        * documents. So copy those as well. */
+
+       t_end = notmuch->xapian_db->allterms_end ("XTIMESTAMP");
+
+       for (t = notmuch->xapian_db->allterms_begin ("XTIMESTAMP");
+            t != t_end;
+            t++)
+       {
+           Xapian::PostingIterator p, p_end;
+           std::string term = *t;
+
+           p_end = notmuch->xapian_db->postlist_end (term);
+
+           for (p = notmuch->xapian_db->postlist_begin (term);
+                p != p_end;
+                p++)
+           {
+               Xapian::Document document;
+               time_t mtime;
+               notmuch_directory_t *directory;
+
+               if (do_progress_notify) {
+                   progress_notify (closure, (double) count / total);
+                   do_progress_notify = 0;
+               }
+
+               document = find_document_for_doc_id (notmuch, *p);
+               mtime = Xapian::sortable_unserialise (
+                   document.get_value (NOTMUCH_VALUE_TIMESTAMP));
+
+               directory = notmuch_database_get_directory (notmuch,
+                                                           term.c_str() + 10);
+               notmuch_directory_set_mtime (directory, mtime);
+               notmuch_directory_destroy (directory);
+           }
+       }
+    }
+
+    db->set_metadata ("version", STRINGIFY (NOTMUCH_DATABASE_VERSION));
+    db->flush ();
+
+    /* Now that the upgrade is complete we can remove the old data
+     * and documents that are no longer needed. */
+    if (version < 1) {
+       notmuch_query_t *query = notmuch_query_create (notmuch, "");
+       notmuch_messages_t *messages;
+       notmuch_message_t *message;
+       char *filename;
+
+       for (messages = notmuch_query_search_messages (query);
+            notmuch_messages_has_more (messages);
+            notmuch_messages_advance (messages))
+       {
+           if (do_progress_notify) {
+               progress_notify (closure, (double) count / total);
+               do_progress_notify = 0;
+           }
+
+           message = notmuch_messages_get (messages);
+
+           filename = _notmuch_message_talloc_copy_data (message);
+           if (filename && *filename != '\0') {
+               _notmuch_message_clear_data (message);
+               _notmuch_message_sync (message);
+           }
+           talloc_free (filename);
+
+           notmuch_message_destroy (message);
+       }
+
+       notmuch_query_destroy (query);
+    }
+
+    if (version < 1) {
+       Xapian::TermIterator t, t_end;
+
+       t_end = notmuch->xapian_db->allterms_end ("XTIMESTAMP");
+
+       for (t = notmuch->xapian_db->allterms_begin ("XTIMESTAMP");
+            t != t_end;
+            t++)
+       {
+           Xapian::PostingIterator p, p_end;
+           std::string term = *t;
+
+           p_end = notmuch->xapian_db->postlist_end (term);
+
+           for (p = notmuch->xapian_db->postlist_begin (term);
+                p != p_end;
+                p++)
+           {
+               if (do_progress_notify) {
+                   progress_notify (closure, (double) count / total);
+                   do_progress_notify = 0;
+               }
+
+               db->delete_document (*p);
+           }
+       }
+    }
+
+    if (timer_is_active) {
+       /* Now stop the timer. */
+       timerval.it_interval.tv_sec = 0;
+       timerval.it_interval.tv_usec = 0;
+       timerval.it_value.tv_sec = 0;
+       timerval.it_value.tv_usec = 0;
+       setitimer (ITIMER_REAL, &timerval, NULL);
+
+       /* And disable the signal handler. */
+       action.sa_handler = SIG_IGN;
+       sigaction (SIGALRM, &action, NULL);
+    }
+
+    return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+}
+
+/* We allow the user to use arbitrarily long paths for directories. But
+ * we have a term-length limit. So if we exceed that, we'll use the
+ * SHA-1 of the path for the database term.
+ *
+ * Note: This function may return the original value of 'path'. If it
+ * does not, then the caller is responsible to free() the returned
+ * value.
+ */
+const char *
+_notmuch_database_get_directory_db_path (const char *path)
+{
+    int term_len = strlen (_find_prefix ("directory")) + strlen (path);
 
     if (term_len > NOTMUCH_TERM_MAX)
-       return notmuch_sha1_of_string (key);
+       return notmuch_sha1_of_string (path);
     else
-       return strdup (key);
+       return path;
 }
 
+/* Given a path, split it into two parts: the directory part is all
+ * components except for the last, and the basename is that last
+ * component. Getting the return-value for either part is optional
+ * (the caller can pass NULL).
+ *
+ * The original 'path' can represent either a regular file or a
+ * directory---the splitting will be carried out in the same way in
+ * either case. Trailing slashes on 'path' will be ignored, and any
+ * cases of multiple '/' characters appearing in series will be
+ * treated as a single '/'.
+ *
+ * Allocation (if any) will have 'ctx' as the talloc owner. But
+ * pointers will be returned within the original path string whenever
+ * possible.
+ *
+ * Note: If 'path' is non-empty and contains no non-trailing slash,
+ * (that is, consists of a filename with no parent directory), then
+ * the directory returned will be an empty string. However, if 'path'
+ * is an empty string, then both directory and basename will be
+ * returned as NULL.
+ */
 notmuch_status_t
-notmuch_database_set_timestamp (notmuch_database_t *notmuch,
-                               const char *key, time_t timestamp)
+_notmuch_database_split_path (void *ctx,
+                             const char *path,
+                             const char **directory,
+                             const char **basename)
 {
-    Xapian::Document doc;
-    Xapian::WritableDatabase *db;
-    unsigned int doc_id;
-    notmuch_private_status_t status;
-    notmuch_status_t ret = NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
-    char *db_key = NULL;
+    const char *slash;
+
+    if (path == NULL || *path == '\0') {
+       if (directory)
+           *directory = NULL;
+       if (basename)
+           *basename = NULL;
+       return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+    }
 
-    if (notmuch->mode == NOTMUCH_DATABASE_MODE_READ_ONLY) {
-       fprintf (stderr, "Attempted to update a read-only database.\n");
-       return NOTMUCH_STATUS_READONLY_DATABASE;
+    /* Find the last slash (not counting a trailing slash), if any. */
+
+    slash = path + strlen (path) - 1;
+
+    /* First, skip trailing slashes. */
+    while (slash != path) {
+       if (*slash != '/')
+           break;
+
+       --slash;
     }
 
-    db = static_cast <Xapian::WritableDatabase *> (notmuch->xapian_db);
-    db_key = timestamp_db_key (key);
+    /* Then, find a slash. */
+    while (slash != path) {
+       if (*slash == '/')
+           break;
 
-    try {
-       status = find_timestamp_document (notmuch, db_key, &doc, &doc_id);
+       if (basename)
+           *basename = slash;
 
-       doc.add_value (NOTMUCH_VALUE_TIMESTAMP,
-                      Xapian::sortable_serialise (timestamp));
+       --slash;
+    }
 
-       if (status == NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_NO_DOCUMENT_FOUND) {
-           char *term = talloc_asprintf (NULL, "%s%s",
-                                         _find_prefix ("timestamp"), db_key);
-           doc.add_term (term);
-           talloc_free (term);
+    /* Finally, skip multiple slashes. */
+    while (slash != path) {
+       if (*slash != '/')
+           break;
 
-           db->add_document (doc);
-       } else {
-           db->replace_document (doc_id, doc);
-       }
+       --slash;
+    }
 
-    } catch (const Xapian::Error &error) {
-       fprintf (stderr, "A Xapian exception occurred setting timestamp: %s.\n",
-                error.get_msg().c_str());
-       notmuch->exception_reported = TRUE;
-       ret = NOTMUCH_STATUS_XAPIAN_EXCEPTION;
+    if (slash == path) {
+       if (directory)
+           *directory = talloc_strdup (ctx, "");
+       if (basename)
+           *basename = path;
+    } else {
+       if (directory)
+           *directory = talloc_strndup (ctx, path, slash - path + 1);
     }
 
-    if (db_key)
-       free (db_key);
+    return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+}
 
-    return ret;
+notmuch_status_t
+_notmuch_database_find_directory_id (notmuch_database_t *notmuch,
+                                    const char *path,
+                                    unsigned int *directory_id)
+{
+    notmuch_directory_t *directory;
+    notmuch_status_t status;
+
+    if (path == NULL) {
+       *directory_id = 0;
+       return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+    }
+
+    directory = _notmuch_directory_create (notmuch, path, &status);
+    if (status) {
+       *directory_id = -1;
+       return status;
+    }
+
+    *directory_id = _notmuch_directory_get_document_id (directory);
+
+    notmuch_directory_destroy (directory);
+
+    return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
 }
 
-time_t
-notmuch_database_get_timestamp (notmuch_database_t *notmuch, const char *key)
+const char *
+_notmuch_database_get_directory_path (void *ctx,
+                                     notmuch_database_t *notmuch,
+                                     unsigned int doc_id)
 {
-    Xapian::Document doc;
-    unsigned int doc_id;
-    notmuch_private_status_t status;
-    char *db_key = NULL;
-    time_t ret = 0;
+    Xapian::Document document;
 
-    db_key = timestamp_db_key (key);
+    document = find_document_for_doc_id (notmuch, doc_id);
 
-    try {
-       status = find_timestamp_document (notmuch, db_key, &doc, &doc_id);
+    return talloc_strdup (ctx, document.get_data ().c_str ());
+}
 
-       if (status == NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_NO_DOCUMENT_FOUND)
-           goto DONE;
+/* Given a legal 'filename' for the database, (either relative to
+ * database path or absolute with initial components identical to
+ * database path), return a new string (with 'ctx' as the talloc
+ * owner) suitable for use as a direntry term value.
+ *
+ * The necessary directory documents will be created in the database
+ * as needed.
+ */
+notmuch_status_t
+_notmuch_database_filename_to_direntry (void *ctx,
+                                       notmuch_database_t *notmuch,
+                                       const char *filename,
+                                       char **direntry)
+{
+    const char *relative, *directory, *basename;
+    Xapian::docid directory_id;
+    notmuch_status_t status;
 
-       ret =  Xapian::sortable_unserialise (doc.get_value (NOTMUCH_VALUE_TIMESTAMP));
-    } catch (Xapian::Error &error) {
-       ret = 0;
-       goto DONE;
+    relative = _notmuch_database_relative_path (notmuch, filename);
+
+    status = _notmuch_database_split_path (ctx, relative,
+                                          &directory, &basename);
+    if (status)
+       return status;
+
+    status = _notmuch_database_find_directory_id (notmuch, directory,
+                                                 &directory_id);
+    if (status)
+       return status;
+
+    *direntry = talloc_asprintf (ctx, "%u:%s", directory_id, basename);
+
+    return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+}
+
+/* Given a legal 'path' for the database, return the relative path.
+ *
+ * The return value will be a pointer to the originl path contents,
+ * and will be either the original string (if 'path' was relative) or
+ * a portion of the string (if path was absolute and begins with the
+ * database path).
+ */
+const char *
+_notmuch_database_relative_path (notmuch_database_t *notmuch,
+                                const char *path)
+{
+    const char *db_path, *relative;
+    unsigned int db_path_len;
+
+    db_path = notmuch_database_get_path (notmuch);
+    db_path_len = strlen (db_path);
+
+    relative = path;
+
+    if (*relative == '/') {
+       while (*relative == '/' && *(relative+1) == '/')
+           relative++;
+
+       if (strncmp (relative, db_path, db_path_len) == 0)
+       {
+           relative += db_path_len;
+           while (*relative == '/')
+               relative++;
+       }
     }
 
-  DONE:
-    if (db_key)
-       free (db_key);
+    return relative;
+}
 
-    return ret;
+notmuch_directory_t *
+notmuch_database_get_directory (notmuch_database_t *notmuch,
+                               const char *path)
+{
+    notmuch_status_t status;
+
+    return _notmuch_directory_create (notmuch, path, &status);
 }
 
 /* Find the thread ID to which the message with 'message_id' belongs.
@@ -850,14 +1294,38 @@ _notmuch_database_link_message_to_children (notmuch_database_t *notmuch,
     return ret;
 }
 
+static const char *
+_notmuch_database_generate_thread_id (notmuch_database_t *notmuch)
+{
+    /* 16 bytes (+ terminator) for hexadecimal representation of
+     * a 64-bit integer. */
+    static char thread_id[17];
+    Xapian::WritableDatabase *db;
+
+    db = static_cast <Xapian::WritableDatabase *> (notmuch->xapian_db);
+
+    notmuch->last_thread_id++;
+
+    sprintf (thread_id, "%016llx", notmuch->last_thread_id);
+
+    db->set_metadata ("last_thread_id", thread_id);
+
+    return thread_id;
+}
+
 /* Given a (mostly empty) 'message' and its corresponding
  * 'message_file' link it to existing threads in the database.
  *
  * We first look at 'message_file' and its link-relevant headers
  * (References and In-Reply-To) for message IDs. We also look in the
- * database for existing message that reference 'message'.
+ * database for existing message that reference 'message'. In either
+ * case, we will assign to the current message the first thread_id
+ * found (through either parent or child). We will also merge any
+ * existing, distinct threads where this message belongs to both,
+ * (which is not uncommon when mesages are processed out of order).
  *
- * The end result is to call _notmuch_message_ensure_thread_id which
+ * Finally, if not thread ID has been found through parent or child,
+ * we call _notmuch_message_generate_thread_id to generate a new
  * generates a new thread ID if the message doesn't connect to any
  * existing threads.
  */
@@ -880,8 +1348,12 @@ _notmuch_database_link_message (notmuch_database_t *notmuch,
     if (status)
        return status;
 
-    if (thread_id == NULL)
-       _notmuch_message_ensure_thread_id (message);
+    /* If not part of any existing thread, generate a new thread ID. */
+    if (thread_id == NULL) {
+       thread_id = _notmuch_database_generate_thread_id (notmuch);
+
+       _notmuch_message_add_term (message, "thread", thread_id);
+    }
 
     return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
 }
@@ -903,11 +1375,13 @@ notmuch_database_add_message (notmuch_database_t *notmuch,
     if (message_ret)
        *message_ret = NULL;
 
+    ret = _notmuch_database_ensure_writable (notmuch);
+    if (ret)
+       return ret;
+
     message_file = notmuch_message_file_open (filename);
-    if (message_file == NULL) {
-       ret = NOTMUCH_STATUS_FILE_ERROR;
-       goto DONE;
-    }
+    if (message_file == NULL)
+       return NOTMUCH_STATUS_FILE_ERROR;
 
     notmuch_message_file_restrict_headers (message_file,
                                           "date",
@@ -988,23 +1462,24 @@ notmuch_database_add_message (notmuch_database_t *notmuch,
            goto DONE;
        }
 
+       _notmuch_message_add_filename (message, filename);
+
        /* Is this a newly created message object? */
        if (private_status == NOTMUCH_PRIVATE_STATUS_NO_DOCUMENT_FOUND) {
-           _notmuch_message_set_filename (message, filename);
            _notmuch_message_add_term (message, "type", "mail");
-       } else {
-           ret = NOTMUCH_STATUS_DUPLICATE_MESSAGE_ID;
-           goto DONE;
-       }
 
-       ret = _notmuch_database_link_message (notmuch, message, message_file);
-       if (ret)
-           goto DONE;
+           ret = _notmuch_database_link_message (notmuch, message,
+                                                 message_file);
+           if (ret)
+               goto DONE;
 
-       date = notmuch_message_file_get_header (message_file, "date");
-       _notmuch_message_set_date (message, date);
+           date = notmuch_message_file_get_header (message_file, "date");
+           _notmuch_message_set_date (message, date);
 
-       _notmuch_message_index_file (message, filename);
+           _notmuch_message_index_file (message, filename);
+       } else {
+           ret = NOTMUCH_STATUS_DUPLICATE_MESSAGE_ID;
+       }
 
        _notmuch_message_sync (message);
     } catch (const Xapian::Error &error) {
@@ -1029,6 +1504,60 @@ notmuch_database_add_message (notmuch_database_t *notmuch,
     return ret;
 }
 
+notmuch_status_t
+notmuch_database_remove_message (notmuch_database_t *notmuch,
+                                const char *filename)
+{
+    Xapian::WritableDatabase *db;
+    void *local = talloc_new (notmuch);
+    const char *prefix = _find_prefix ("file-direntry");
+    char *direntry, *term;
+    Xapian::PostingIterator i, end;
+    Xapian::Document document;
+    notmuch_status_t status;
+
+    status = _notmuch_database_ensure_writable (notmuch);
+    if (status)
+       return status;
+
+    db = static_cast <Xapian::WritableDatabase *> (notmuch->xapian_db);
+
+    status = _notmuch_database_filename_to_direntry (local, notmuch,
+                                                    filename, &direntry);
+    if (status)
+       return status;
+
+    term = talloc_asprintf (notmuch, "%s%s", prefix, direntry);
+
+    find_doc_ids_for_term (notmuch, term, &i, &end);
+
+    for ( ; i != end; i++) {
+       Xapian::TermIterator j;
+
+       document = find_document_for_doc_id (notmuch, *i);
+
+       document.remove_term (term);
+
+       j = document.termlist_begin ();
+       j.skip_to (prefix);
+
+       /* Was this the last file-direntry in the message? */
+       if (j == document.termlist_end () ||
+           strncmp ((*j).c_str (), prefix, strlen (prefix)))
+       {
+           db->delete_document (document.get_docid ());
+           status = NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;
+       } else {
+           db->replace_document (document.get_docid (), document);
+           status = NOTMUCH_STATUS_DUPLICATE_MESSAGE_ID;
+       }
+    }
+
+    talloc_free (local);
+
+    return status;
+}
+
 notmuch_tags_t *
 _notmuch_convert_tags (void *ctx, Xapian::TermIterator &i,
                       Xapian::TermIterator &end)