lib: add public accessor for database from query

This is to make it easier for clients of the library to update to the
new error code returning versions of notmuch_query_search_messages

lib: deprecate notmuch_query_search_{threads, messages}

The CLI (and bindings) code should really be updated to use the new
status-code-returning versions. Here are some warnings to prod us (and
other clients) to do so.

lib: define NOTMUCH_DEPRECATED macro, document its use.

This has been tested with gcc and clang.

lib: Only sync modified message documents

Previously, we updated the database copy of a message on every call to
_notmuch_message_sync, even if nothing had changed.  In particular,
this always happens on a thaw, so a freeze/thaw pair with no
modifications between still caused a database update.

We only modify message documents in a handful of places, so keep track
of whether the document has been modified and only sync it when
necessary.  This will be particularly important when we add message
revision tracking.

configure: support --without-ruby

Apparently some ruby installs are broken in ways that prevent the ruby
bindings from building.

configure: support --with-docs=no

Since we promise --with-foo=no is equivalent to --without-foo

configure: alphabetize --without help

Now that the "without" options seem to be multiplying, try to make it
easier for people to find the one they want.

configure: fix typo in comment

Some lazy person, probably me, forgot to press shift.

cli: enable notmuch --help command

This functionality seems to have been undocumented, if it ever
existed. Document it now.

doc: whitespace cleanup for notmuch.rst

replace leading spaces with tabs

build: add "set -eu" to version script generation

It turns out that on certain systems like FreeBSD, c++filt is not
installed by default. It's basically OK if we fail the build in that
case, but what's really not OK is for the build to continue and
generate bad binaries.

configure: whitespace cleanup

This is the result of running M-x whitespace-cleanup in emacs.  In
particular this replaces some spaces at the beginning of lines with
tabs.

configure: add --without-docs switch

Previously documentation was build automatically if sphinx/doxygen
executable were found. The switch is used to unconditionally disable
sphinx/doxygen detection and therefor, building of documentation
(including man pages).

replace hardcoded "python" with configured python command

Thanks to FreeBSD port maintainer Mikhail for report and the original
the original patch.

This is the right thing (TM) and also apparently fixes the build on
FreeBSD.

Fix documentation for notmuch--tag-hook functions

The second argument to notmuch-tag is now called tag-changes, but the
documentation for notmuch-before-tag-hook and notmuch-after-tag-hook
still used the old argument name `tags'. This resulted in broken hooks
when following the documentation.

Merge tag '0.20.2'

notmuch 0.20.2 release

Conflicts:
NEWS

version: update to 0.20.2

As usual, bump python version at same time.

debian: update changelog for 20.2-1

Actual changes are documented in the bug.

NEWS for 0.20.2

Just the one bug fix

emacs: tree: mark read change

The mark read code for tree mode did not get updated in the recent
changes. This updates it to match. Since the user can customize the
mark read logic we just call the show logic in the message pane.

test: add initial ruby tests

This is pretty much a line by line translation of the existing python
tests, with two new tests for the count API.

build/ruby: use notmuch configure script values for shared lib

This is supposed to help build on systems like MacOS with different
conventions for naming shared libraries. We have already computed the
relevant names, so doing it again in ruby seems like a bad idea.

lib, ruby: make use of -Wl,--no-undefined configurable

In particular this is supposed to help build on systems (presumably
using a non-gnu ld) where this flag is not available.

emacs search: stash query

Add keybinding c q to stash the current query in search mode.

build: integrate building ruby bindings into notmuch build process

Because ruby generates a Makefile, we have to use recursive make.
Because mkmf.rb hardcodes the name Makefile, put our Makefile{.local}
in the parent directory.

lib: reject relative paths in n_d_{create,open}_verbose

There are many places in the notmuch code where the path is assumed to be absolute. If someone (TM) wants a project, one could remove these assumptions. In the mean time, prevent users from shooting themselves in the foot.

Update test suite mark tests for this error as no longer broken, and
also convert some tests that used relative paths for nonexistent
directories.

lib: add NOTMUCH_STATUS_PATH_ERROR

The difference with FILE_ERROR is that this is for things that are
wrong with the path before looking at the disk.

Add some 3 tests; two broken as a reminder to actually use this new
code.

release-checks: check that git working directory is clean

Before release check that there are no uncommitted changes and
that there are no files in working directory that possibly should
have been added to the repository.

Amended by db: remove --ignored, since that seems like too much
trouble.

test: redirect man output to /dev/null

In the case the these tests fail, they generate a bunch of output;
this output is not very interesting because it is just the successful
output of a man page. It does however make it hard to see what tests are actually failing, even with NOTMUCH_TEST_QUIET

configure: add ability to force python version via environment

This is makes it a bit easier to run our test suite under alternative
python versions.

test: make python tests compatible with python3

Making the test suite actually run them with python3 is left for
future work.

doc: add minimal note about shared options.

The example is a bit silly, but notmuch subcommand --help is actually
not equivalent to "notmuch --help subcommand".

Merge branch 'release'

20.1 plus NEWS fixup

NEWS: missing NEWS for 20.1

Embarrassingly, these were not included in the actual 20.1 release

debian: change stanza for 0.20.1

version: bump to 20.1

cli: add standard option processing to config, help and setup

In particular this fixes a recently encountered bug where the
"--config" argument to "notmuch setup" is silently ignored, which the
unpleasant consequence of overwriting the users config file.

cli: define shared options, use for --help and --version

Unfortunately it seems trickier to support --config globally

The non-trivial changes are in notmuch.c; most of the other changes
consists of blindly inserting two lines into every subcommand.

cli: refactor notmuch_help_command

Create a new private entry point _help_for so that we can call help
without simulating a command line invokation to set up the arguments.

cli: ignore config argument of notmuch_help_command

We call it with NULL at one point anyway, so it needs to work with
NULL. Since the only place we use talloc is right before exec, there
is no harm in always using NULL.

cli: change "setup" to "set up" where used as a verb

The word "setup" is a noun, not a verb.  Change occurrences of "setup"
where used as a verb to "set up".

emacs: Added "is:<tag>" style completion to notmuch-read-query.

The notmuch-search-terms man page states that "tag:<tag>" is equivalent
to "is:<tag>". Completion for "is:<tag>" style searches is now supported
in the Emacs interface.

Amended by David Bremner: combine lexical-let and let into
lexical-let*

test: remove redundant 'file' command from gdb scripts.

Quoting Debian bug 787341

   It failed to build on arm64: the last ten tests in T070-insert
   failed.

   What's happening here is that GDB is segfaulting in response to
   the
   "file" command. GDB on arm64 can be a bit buggy.

   However, the "file" command is redundant here as GDB has already
   got
   the file from the --args on the command line.

Merge tag '0.20'

notmuch 0.20 release

NEWS: bump date

debian: changelog stanza for 0.20-1

version: bump to 0.20

drop mention of notmuch-emacs-mua

Merge tag '0.20_rc2'

notmuch 0.20~rc2 release

debian: changelog stanza for 0.20~rc2-1

version: bump to 0.20~rc2

python: use absolute import for SOVERSION

Apparently python3 needs this.

docs: initial draft of NEWS for 0.20

This is meant as much to jog people's memory as to be definitive.

configure: Add sanity checking for environment variables

Passing in environment variables incompatible with the compiler may
cause other parts of the configure script to fail in hard to
understand ways, so we abort early.

Merge tag '0.20_rc1'

notmuch 0.20~rc1 release

debian: add new symbols to libnotmuch4.symbols

Since we only add new symbols, no SONAME bump is needed.

debian: call upstream configure script directly

dh defaults for dh_auto_configure are now incompatible with notmuch's
homebrew configure script (at least in debian experimental)

version: bump to 0.20~rc1

debian: changelog stanza for 0.20~rc1

notmuch-mutt: fix xargs/ln usage for OpenBSD compatibility

- xargs: use -r flag instead of --no-run-if-empty
- ln: use -I flag/3rd form of ln command instead of -t flag/4th form

Signed-off-by: Stefano Zacchiroli <zack@upsilon.cc>

test: move nonexistent directory to something under notmuch's control.

Apparently some systems actually have a directory called /nonexist[ae]nt.
It's hard to fathom a good reason for that, but oh well. As long as we
don't create such a directory inside the notmuch source tree, the new
version should be more robust.

test: be consistent about spelling `nonexistent'

Apparently most of the misspellings are my fault.

emacs: show: hide large text attachments by default

notmuch-show can be slow displaying large attachments so hide them by
default. The default maximum size is 10000 bytes/characters but it is
customizable.

Note that notmuch-show-insert-bodypart is also called from the reply
code so we need to be a little careful.

test/thread-order: more robust loop exit in case of broken input

When creating $THREADS data it may end of not having 'None' at all
or the numbers in line output yields a loop.

To avoid loop the value in current array index is set to 'None'
so that if the same item is reached again the loop will end.

Also empty string as next array index will end the loop.

notmuch-emacs-mua: non-forking escape () usage with backslash '\' escape

Use the printf -v convention to give output variable as argument
to escape () function so no subshell needs to be executed for
escaping input. The '-v' option to escape () is just syntactic
sugar for better understanding.

Also, backslash is now escaped with another backslash for emacs. This
ie especially important at the end of string.

`echo` is no longer used to write escaped output -- it might interpret
the escapes itself.

nmbug-status: Use 'show-ref --heads' for loading configs

When loading configs from Git, the bare branch name (without a
refs/heads/ prefix or similar) matches all branches of that name
(including remote-tracking branches):

  .nmbug $ git show-ref config
  48f3bbf1d1492e5f3d2f01de6ea79a30d3840f20 refs/heads/config
  48f3bbf1d1492e5f3d2f01de6ea79a30d3840f20 refs/remotes/origin/config
  4b6dbd9ffd152e7476f5101eff26747f34497cee refs/remotes/wking/config

Instead of relying on the ordering of the matching references, use
--heads to ensure we only match local branches.

NEWS: fix 'not' -> 'now' typo in 0.19 nmbug section

test: make one error output test more robust.

Since notmuch_database_status_string can return NULL, passing it
directly to fputs is not a good idea.

test: add more error reporting tests

This second half of the error reporting tests actually uses the function
notmuch_database_status_string to retrieve the last logged error

lib: eliminate fprintf from _notmuch_message_file_open

You may wonder why _notmuch_message_file_open_ctx has two parameters.
This is because we need sometime to use a ctx which is a
notmuch_message_t. While we could get the database from this, there is
no easy way in C to tell type we are getting.

lib: replace almost all fprintfs in library with _n_d_log

This is not supposed to change any functionality from an end user
point of view. Note that it will eliminate some output to stderr. The
query debugging output is left as is; it doesn't really fit with the
current primitive logging model. The remaining "bad" fprintf will need
an internal API change.

lib: add private function to extract the database for a message.

This is needed by logging in functions outside message.cc that take
only a notmuch_message_t object.

lib: add a log function with output to a string in notmuch_database_t

In principle in the future this could do something fancier than
asprintf.

lib: add "verbose" versions of notmuch_database_{open,create}

The compatibility wrapper ensures that clients calling
notmuch_database_open will receive consistent output for now.

The changes to notmuch-{new,search} and test/symbol-test are just to
make the test suite pass.

The use of IGNORE_RESULT is justified by two things. 1) I don't know
what else to do.  2) asprintf guarantees the output string is NULL if
an error occurs, so at least we are not passing garbage back.

test: add error reporting tests

This first half of the tests is all that don't need to retrieve the
the error string explicitly from the notmuch database structure.

test: add support for compiling and running C snippets

This is to limit the copy-pasta involved in running C tests. I decided
to keep things simple and not try to provide an actual C skeleton.

The setting of LD_LIBRARY_PATH is to force using the built libnotmuch
rather than any potential system one.

test: Add two tests for error output from notmuch_database_open

This is arguably testing the same thing twice, but in the brave new
future where we don't use printf anymore, each subcommand will be
responsible for handling the output on it's own.

nmbug-status: Clarify errors for illegible configs

Carl Worth pointed out that errors like:

  $ ./nmbug-status
  fatal: Not a git repository: '/home/cworth/.nmbug'
  fatal: Not a git repository: '/home/cworth/.nmbug'
  Traceback (most recent call last):
    File "./nmbug-status", line 254, in <module>
      config = read_config(path=args.config)
    File "./nmbug-status", line 73, in read_config
      return json.load(fp)
    File "/usr/lib/python2.7/json/__init__.py", line 290, in load
      **kw)
    File "/usr/lib/python2.7/json/__init__.py", line 338, in loads
      return _default_decoder.decode(s)
    File "/usr/lib/python2.7/json/decoder.py", line 366, in decode
      obj, end = self.raw_decode(s, idx=_w(s, 0).end())
    File "/usr/lib/python2.7/json/decoder.py", line 384, in raw_decode
      raise ValueError("No JSON object could be decoded")
  ValueError: No JSON object could be decoded

are not particularly clear.  With this commit, we'll get output like:

  $ ./nmbug-status
  fatal: Not a git repository: '/home/wking/.nmbug'
  No local branch 'config' in /home/wking/.nmbug.  Checkout a local
  config branch or explicitly set --config.

which is much more accessible.  I've also added user-friendly messages
for a number of other config-parsing errors.

lib: make notmuch_query_count_messages explicitely exact

The default is actually exact if no checkatleast parameter is
specified. This change makes that explicit, mainly for documentation,
but also to be safe in the unlikely event of a change of default.

[ commit message rewritten by db based on id:87lho0nlkk.fsf@nikula.org
]

completion: complete addresses in from:/to: search terms

Use the new notmuch address command to do completion for addresses in
from: and to:. Use --output=sender for both for efficiency, even
though --output=recipients would be more accurate for to: prefix
completion.

cli: add support for notmuch command --help

Recognize 'notmuch command --help' at the top level as a special case,
and show help for the command. Note that for simplicity, --help is
only recognized as the first option for the subcommand.

cli: fix top level --help combined with other options

If the top level --help is combined with other options, help
fails. For example:

    $ notmuch --version --help

    Sorry, --help is not a known command. There's not much I can do to help.

Fix this by adjusting argc and argv appropriately. The help command
ignores argv[0] anyway, so we don't have to set it to "help".

CLI: make gpg binary used by libgmime configurable.

Previously we set up a way for the top level notmuch command to choose
which gpg binary was invoked by libgmime. In this commit we add the
(mostly boilerplate) code to allow the notmuch-config command to read
and write this path, and use it in the appropriate struct.

Update tests for new default variable

CLI: set up infrastructure to make path to gpg configurable.

GMIME takes a path to gpg, but we hardcode that path.  In this commit
we set up argument passing and option storage to allow this path to
specified in the top level notmuch command.

python: replace hardcoding of SONAME version

Failing to update this string in globals.py causes failures when the
SONAME changes.  In order to hopefully reduce the number of such
errors, automate the process of setting the SONAME in the python
bindings.

man: fix notmuch-emacs-mua environment section

It's emacsclient command, not comment. Document default values. While
at it, format the environment section similarly to other man pages.

notmuch-emacs-mua: remove -C to keep short options compatible with mutt

Notmuch uses long options exclusively all around. The short options in
notmuch-emacs-mua are intentionally just a compatible subset of
mutt(1). Keep it this way, if only to make documenting the fact easy!

The Notmuch style --client long option remains, of course.

go: add binding for notmuch_message_get_date

lib: bump library minor version

This should have happened in commit 326e18856, but it didn't.

parse-time-string: fix setting and rounding of seconds

If seconds are not specified in the string to be parsed, they're not
set according to the reference time (in the no rounding case) nor
rounded properly (in the rounding up cases). Fix this.

The bug caused searches such as date:10:30..10:30 to match messages
with date exactly 10:30:00 only, and not in range 10:30:00..10:30:59
(inclusive) as documented.

Note that date searches referring "noon" or "5pm" will still be
interpreted as exact to the second.

test: extract and flag second rounding tests as broken

Extract and add some more tests relating to rounding seconds into a
separate subtest, and flag it as broken. If seconds are not specified,
the time is not set or rounded according to the interface defined in
parse-time-string/parse-time-string.h. Instead, seconds are always set
to 00 in reality, which is broken.

test: add some more time tests

Ensure the seconds are set properly.

test: improve the time parsing tests

Set the reference time to 12:13:14 instead of 11:11:00 to ensure hours
and minutes are not mixed up, and seconds are really set instead of
defaulted to 00.

completion: update list of commands in zsh completion.

This is actually generated by the script in

     id:1420289900-29717-2-git-send-email-david@tethera.net

We may as well update the list of commands while we decide if it's
worth automating the process. Note that there is a bit more noise than
expected because it alphabetizes all of the commands with their own
man pages.

cli: add a tool for starting new message in the emacs ui

Add a tool to start composing an email in the Notmuch Emacs UI with
the specified subject, recipients, and message body.

lib: make notmuch shared library install_name be full path on Mac OS X

The install_name of libnotmuch.dylib on Mac OS X is what is written
into a program that links against it.  If it is just the name of the
shared library file, as opposed to the full path, the program won't be
able to find it when it runs and will abort.  Instead, the install_name
should be the full path to the shared library (in its final installed
location).

Why does Notmuch work without this patch when installed via Homebrew?
The answer is twofold.  One, /usr/local/lib is a special location in
which the dynamic linker will look by default to find shared libraries.
Homebrew highly recommends installing to /usr/local, and, assuming it
has been configured this way, the Notmuch library will end up installed
in /usr/local/lib, and the dynamic linker will find it.  Two, Homebrew
globally corrects all install names in dynamically shared libraries and
binaries for each package it installs.  So, even if the install names in
a package's binaries and libraries are incorrect, Homebrew corrects them
automatically, and no one ever knows.

Why does Notmuch work without this patch when installed via MacPorts?
The answer is that MacPorts applies a patch just like this patch to fix
the same problem.

lib: bump SONAME minor version

This indicates upwardly compatible changes, namely adding new symbols.

Although we don't formally need to do this until the next release,
there is no hard in doing it now, as long as we don't bump the minor
version for every addition between now and the release.

lib: add new status reporting API for notmuch_query_search_{m,t}

This at least allows distinguishing between out of memory and Xapian
exceptions. Adding finer grained status codes would allow different
Xapian exceptions to be preserved.

Adding wrappers allows people to transition gradually to the new API,
at the cost of bloating the library API a bit.

cli: fix clang build warnings

Fix the following warning produced by clang 3.5.0:

notmuch-search.c:730:25: warning: initializing 'void *' with an
expression of type 'const notmuch_opt_desc_t (*)[4]' discards
qualifiers [-Wincompatible-pointer-types-discards-qualifiers]
        { NOTMUCH_OPT_INHERIT, &common_options, NULL, 0, 0 },
                               ^~~~~~~~~~~~~~~
1 warning generated.

lib: fix clang build warnings

Fix the following warning produced by clang 3.5.0:

lib/message.cc:899:4: warning: comparison of constant 64 with expression of type 'notmuch_message_flag_t' (aka '_notmuch_message_flag') is always true [-Wtautological-constant-out-of-range-compare]
        ! NOTMUCH_TEST_BIT (message->lazy_flags, flag))
          ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
./lib/notmuch-private.h:70:6: note: expanded from macro 'NOTMUCH_TEST_BIT'
    (_NOTMUCH_VALID_BIT(bit) ? !!((val) & (1ull << (bit))) : 0)
     ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
./lib/notmuch-private.h:68:26: note: expanded from macro '_NOTMUCH_VALID_BIT'
    ((bit) >= 0 && (bit) < CHAR_BIT * sizeof (unsigned long long))
                   ~~~~~ ^ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~